因为是死刑案，案子需要交到了刑部复核。“刑部定如审刑、大理”，依然是死刑。其理由是《宋刑统贼盗律》“谋杀”条的相关规定：“诸谋shā • rén者，徒三年；已伤者，绞；已杀者，斩。”
因为阿云的行为是“谋杀已伤”，所以“当绞刑”。
不过决定权在赵顼手上，赵顼觉得女孩蛮可怜，于是允许其用钱赎罪，实际上是依照许遵的原判，认为有可以减罪的情节。
而这时许遵已经回到大理寺，被提拔为大理寺卿。
针对刑部的判决，许遵指出：“刑部定议非直，云合免所因之罪”，认为刑部的判决不正确，阿云应该从轻发落。
其理由是如果不论青红皂白，“一切按而杀之”，就会“塞其自首之路”，不符合“罪疑惟轻”的断案原则。
同时还指出，如果按照情节本当赦免的罪，都需要通过皇帝的敕命来赦免，如果以后没有敕命的情况下，这些人不就全部该死了？
这完全不符合大宋的法律精神，所以要求刑部再议。
御史台的谏官知道后，立刻弹劾许遵妄法。“遵不伏，请下两制议”，请朝廷将案件发给翰林学士们讨论。
赵顼完全没有想到这案子会变得这么让人头痛，于是“乃令翰林学士司马光、王安石同议”。
王安石和司马光在了解了案件经过后，得出了完全相反的结论，无法达成共识，于是“二人议不同，遂各为奏”。王安石支持许遵的观点，司马光支持刑部的观点。
王安石的断案依据与许遵相同，当作“谋杀已伤，按问欲举，自首，从谋杀减二等论”。
司马光的依据来自《宋刑统》：shā • rén时，“於人有损伤，不在自首之例”，所以阿云不能自首。
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